運動部日前公布名古屋亞運中華代表團名單，其中棒球24人名單出爐後引發熱議，最主要是原本在中職6隊各出1人的原則下，最後只剩4隊有派人，不見原本教練團屬意且目前正在列管中的富邦悍將捕手戴培峰、台鋼雄鷹曾子祐。
對於這次亞運名單引發軒然大波，蔡其昌也不樂見，「這幾年來我們一直努力跟棒協維持很好的默契跟合作關係，未來也希望亞運的徵召，應該先知會聯盟，由聯盟出面來跟6個球團一起協商，看國家需要什麼人才，這是大家都很願意的。」
蔡其昌提到，這次亞運名單引起的風波，是在中職都不知情的情況下由媒體率先曝光名單後才得知，「我們是覺得比較可惜，也導致棒球圈紛擾非常多，希望下次棒協可以直接來通知聯盟，聯盟也很願意出面來協助。」
先前中職與中華棒協曾協商決定，世界12強棒球賽、世界棒球經典賽以及奧運等3大一級國際賽由中職負責組訓及比賽，蔡其昌說：「如果亞運也是要組最強國家隊，勢必就是需要職棒球員，那乾脆亞運也給中職負責組訓跟比賽，因為給聯盟做，我們就會協調所有事情，包括像要不要停賽，我們就會一起來協調。」
蔡其昌表示，自己跟中華棒協理事長都要卸任，提出這個只是自己個人的建議，交給未來的會長、理事長說發揮，希望未來不要再看到因為組成中華隊引發球迷論戰，「我本來就可以願意出面幫忙協調，就不會今天搞得實在是大家都很難過嘛。球迷難過、球隊難過、球員難過，罵來罵去的，太可惜了啦！」
