水利署說明，河川治理規劃必須以完整水系或利害有關之水系為規劃單元，非僅考量「年限」是否屆滿，而是必須針對防洪保護標的與實際治理需求、歷年災害情形與潛勢分析、河道變遷與水道沖淤狀況，以及周邊經濟社會發展與整體生態治理效益等面向，進行嚴謹的綜合評估。當流域現況發生顯著變化，導致原治理計畫已不符實際需求時，即會啟動檢討作業，將有限的治水資源與人力，精準投入於最迫切需要改善的河段。
經檢視近3年間曾發生重大淹水災害事件主要係受短延時強降雨、區域排水容量不足、都市低窪地區積淹水或內水排除不及等因素造成，中央管河川或排水溢淹案件，其災前流域狀況與現行規劃或治理計畫之調查資料無顯著變化，溢淹係降雨超過水道保護標準，非屬規劃或治理計畫檢討因素。若災後經評估流域狀況已顯著變化者，即辦理相關檢討作業。例如報導所提及馬太鞍溪於114年發生堰塞湖溢流災害後，水利署於114年12月30日完成治理計畫檢討變更，115年更擴大辦理整個花蓮溪水系治理規劃檢討，絕無外界所指延宕怠惰之情事。
水利署補充說明，短延時強降雨發生頻率愈來愈高，近期0822南部多日豪雨，經分析多處超過排水系統及道路周邊收集系統之設計保護標準，甚至部分雨量站累積雨量已達100年重現期，大幅超過設計保護標準。水利署與各縣市政府於第一時間即迅速調配抽水機應變，以減輕災情。南部地區如嘉義、台南、高雄、屏東等縣市多為地勢低漥平原區，相關水道保護標準多低於台北市，為淹水高風險地區，需加速辦理相關治水措施，以降低災損。
水利署強調，未來將持續檢討辦理治理規劃及治理計畫修正作業，除加強控管辦理期程並協助各河川分署執行外，持續追蹤執行單位辦理情形，確保防洪能力符合現況需求。另外，每年依河道沖淤情形辦理疏濬，濬深主深槽，導正流心，減少河道變遷幅度避免發生洪災。中央管河川115年度目前執行疏濬量超前目標1742萬立方公尺，確保通洪安全。
行政院已成立水及流域永續推動小組，協助淹水高風險地區推動系統性治理，包含由陳政委召開8次策略指導會議、院長及副院長召開6次政策指導會議，並已於115年4月8日研提6年水及流域永續發展行動計畫，各部會將視政府財政狀況依優先次序及政策重點推動辦理，各年度執行內容將由各部會於行動計畫架構下提出，並由推動小組工作會議盤點及資源對齊，經確認後循公建計畫程序爭取經費據以執行。面對氣候變遷挑戰，未來除加速辦理水道治理，亦將協助推動逕流分擔、在地滯洪等土地承洪措施，以提升土地承洪韌性。目前經濟部已補助縣市針對低窪地區評估加強抽排方案、第二道防線、逕流分擔及在地滯洪評估，方案評估完成後將持續協助辦理，以減輕民眾淹水之苦。
