組委會先前以節約成本與環保為由，取消了原定可容納1.5萬人的高層公寓式選手村興建計畫，原預計需耗資300億日圓的選手村建案因建材價格大幅上漲，預估成本翻倍，導致組委會變更方案，改採組合式貨櫃屋與大型郵輪作為選手住宿設施。
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不過由於參賽人數超過預期，面對開幕在即，貨櫃住宿區仍面臨房間短缺問題，官方正緊急尋找有空房的飯店補救，由於開幕期間適逢日本4天連假，房間調度極為困難。
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愛知縣知事兼組委會主席大村秀章指出，亞洲奧林匹克理事會（OCA）提出預期之外的要求增加了600億日圓支出，加上物價與人工成本上漲又增加550億日圓。不過他強調，賽事預計帶來的經濟效益高達3.68兆日圓（約台幣7500億元），並呼籲國際賽事應降低運營門檻，避免造成「僅有石油富國或中國大陸才能主辦」的現象。
此外，主辦方還需面對當地高溫熱浪、豪雨等天候考驗，以及公眾關注度較低等挑戰。賽事官員坦言，目前現場人力極度緊張，只能在極端條件下全力確保賽事順利進行。
