疾管署監測資料顯示，國內流感疫情緩降仍高且處流行期，第41周(10/11-10/17)類流感門急診就診計123,820人次，較前一周下降5.4%。另上周(10/13-10/19)新增159例流感併發重症病例及44例死亡。目前社區中流行之流感病毒以A型為主，其中以A型H1N1占92.7%為高。
疾管署發言人林明誠表示，若持續下降，最快可望於11月上旬正式脫離流感流行期。適逢氣溫逐漸轉涼，將進入呼吸道傳染病流行季節，因此疾管署今日宣布，延長擴大公費流感抗病毒藥劑使用條件，「有類流感症狀，且具下列身分之流感高傳播族群」之適用期限至今年11月15日止，以維護民眾健康。
1. 醫事單位之防疫相關人員(含具執業登記醫事人員及醫療院所非醫事人員)。
2. 安養、長期照顧(服務)等機構之受照顧者及所屬工作人員。
3. 幼兒園及托育機構工作人員、居家托育人員（保母）。
4. 幼兒園、國小、國中、高中、高職、五專 1 至 3 年級學生。
5. 與流感重症高風險族群同住或其照顧者。
6. 禽畜養殖等相關行業工作人員、動物園工作人員及動物防疫人員。
7. 其他人口密集機構(如軍營等)易發生群聚之人員。
另國內新冠肺炎疫情已連續兩周低於流行閾值，疾管署今日(10/20)宣布，國內新冠疫情脫離流行期。第41周(10/11-10/17)新冠門急診就診計3,873人次，較前一周(10/4-10/10)下降27.7%；近7日(10/13-10/19)新增25例本土重症病例及5例本土死亡病例。近4周本土病例變異株以PQ.16.1.1為多，其次為NB.1.8.1。
疾管署已於10月19日起增加提供不同製程的Novavax新冠疫苗讓民眾接種，滿12歲以上且尚未接種本季新冠疫苗的公費對象可擇Moderna或Novavax任一廠牌接種。
今年度秋冬公費流感及新冠疫苗自10月1日起正式開打，截至10月19日，國內流感疫苗接種數累計約340萬人次，為去(2025)年同期307萬人次之1.1倍、新冠疫苗接種累計已逾107萬人次，為去年同期78萬人次的1.4倍，接種情形踴躍。
