我國在南非設有2駐處，其一為「駐南非代表處」落在首都普勒托利亞（Pretoria），另者為「駐開普敦台北聯絡辦事處」，南非外交部曾強勢要求我代表處去年10月底前遷離首都，經國際聲援及交涉後，南非政府撤除遷處期限，不過今年初再次對我國下通牒，要求3月底前撤出，而5月時南非外交部官網直接將代表處降級為商務辦事處。
外交部發布新聞稿，南非外交部（DIRCO）在未與我國協商下，於7月21日以政府公報發布公告，逕將我駐處自4月1日起分別改名為駐約翰尼斯堡台北商務辦事處及駐開普敦台北商務辦事處，更錯誤援引聯大第2758號決議及「一中政策」，外交部表達嚴正抗議。
林佳龍第一時間指示亞非司及我國駐南非代表處，分別向駐台南非聯絡辦事處及DIRCO嚴正抗議，同時訓令我國駐南非代表處秉持對等及尊嚴原則，持續與南非外交部進行交涉。
外交部表示，南非副總統瑪莎蒂萊（Paul Mashatile）7月14日至18日率團訪中後，南非政府即以政府公報發布上述謬誤公告，顯示中國在南非對我打壓一事變本加厲，斐方甘願屈從於中方壓力對我國施壓，我方至表遺憾與不滿。
外交部重申，我國政府不接受南非政府片面違反1997年雙邊協議的立場不變，將持續秉持對等及尊嚴的原則與南非政府溝通，同時面對斐方屢次片面更改我國駐處名稱及地位的作法，我方也將視相關情形「採取因應反制作為」。
外交部嚴正呼籲，南非作為今（2025）年G20峰會主辦國，更應遵守1997年的雙邊關係法律架構，在台斐雙方獲得協商共識前，不應對我駐處採取任何強制手段，或其他可能干擾駐處運作及僑民服務功能的行動。
