依今年衛生福利部傳染病防治諮詢會預防接種組(ACIP)會議建議，有兩類幼兒接種流感疫苗需要打兩劑，第一類是「首打族」：年滿6個月以上、尚未入小學，且今年十月開打之前從未接種過流感疫苗，今年十月首次接種流感疫苗者要打兩劑。
第二類是「再打族」：年滿6個月以上、未滿3歲，之前僅接種過一劑流感疫苗，漏打第二劑的孩子，保護力不完整，因此，今年十月接種公費流感疫苗，必須重新計算，再打兩劑。兩劑至少間隔28天。
台大小兒感染科醫師李秉穎表示，因為3歲以下的免疫記憶特別不好，所以第二劑很重要，2025年最新實證顯示，6個月至未滿9歲初次接種者，打2劑比僅打1劑的保護效果高出 15%。6個月至未滿3歲幼兒，打2劑比僅打1劑的保護效果高出28%。
李秉穎強調，別看數字好像不是很高，普通流感疫苗的保護效果是50%、60%，提高15%、28%，對幼兒來說是蠻重要的事情，尤其幼兒是流感高風險族群之一。因此呼籲家長不要忘記帶孩子打第二劑流感疫苗，影響孩子的保護力。
疾管署統計至今年11月1日止，約有6.5萬名幼兒尚待接種第二劑，37萬名幼兒尚未接種，家長可依孩子今年接種第一劑時的年齡及過去接種紀錄，「與醫護人員」確認今年需要接種幾劑，「並儘速安排接種」。
另經統計，自今年10月1日起至11月2日，幼兒公費流感疫苗（至少接種一劑）累計接種37.5萬人次，接種率為49.4%，較去(2025)年同期(49.8%)下降0.4%。
