「國家科技寶藏－科學家的秘密基地2.0」展場位於海科館第一特展廳，展期從今年7/3至2029年底，展覽結合國研院旗下的多個研究中心與太空中心特色，涵蓋半導體、地震、海洋等主題，透過介紹不同主題的知識及遊戲體驗，讓年輕孩子體驗國家級科研單位所做的高科技研發工作，並提升科學素養。
進入「國家科技寶藏－科學家的秘密基地2.0」展場，首先要在註冊機台輸入基本資訊，獲得專屬遊戲ID或QR code，之後知能玩展場內的各種遊戲。
一進入展場，台灣海洋科技研究中心（海洋中心）展示7公尺長的勵進研究船1/10模型，另外也可看到勵進研究船與水下機器人（remotely operated vehicle, ROV）的水下探測成果，並有海洋中心自主設計研發的海洋探測科儀設備，此關卡的遊戲要操作水下機器人，在限時內找到5樣隱藏於海底的目標物。
國家地震工程研究中心（國震中心）展區，展示地震工程新技術，以減輕地震災害損失，遊客在此處將扮演抗震工程師，先透過動畫認識隔減震工程原理，之後進行體感互動，左右移動身體來承接正確的隔減震元件，並避開錯誤的物件，現場也提供耐震紙模型屋，讓闖關者自行組裝、搖晃，體會不同結構房屋耐震能力的差異。
國家生物模式中心（生物模式中心）展區，搭配中心運用動物模式、細胞模式、電腦模式來模擬人類疾病的模式，提供藥品及醫材所需的實驗設計及委託試驗服務，設計讓遊客透過觸控螢幕與實物感應等三種趣味小遊戲，認識現今在醫學研究上已經廣泛使用的螢光蛋白與螢光基因，另外也在水族箱實體展示螢光斑馬魚和螢光磚魚。
國家儀器科技研究中心（國儀中心）展區讓遊客扮演光譜科學糾察隊，透過觸控螢幕，以神奇的光學檢測技術，辨識出各種物體獨有的光譜訊息來解決問題，包含進行品質檢測、分辨物體中的雜質、不同的材料或外來物種，甚至還能識別水果甜度的高低。
科技政策研究與資訊中心（科政中心）展區則依據「PRIDE政策研究指標資料庫」設計是非題遊戲，遊客必須仔細解讀螢幕中的圖表資訊，選出正確答案，藉由答題的過程，認識各種數據指標背後的意義。
國家太空中心展區則展示福衛八號等台灣發射的衛星模型，遊戲則讓遊客為火箭裝填正確的燃料與氧化劑，再變身太空人，利用搖桿遠程操控火箭閃避隕石及太空垃圾等障礙物，最後順利將衛星發射至外太空。
台灣半導體研究中心（半導體中心）展區透過動畫，解析半導體晶片製造的過程，接著讓遊客動手將圖卡放在正確的位置，填補製造過程的空缺處，即可使積體電路裝置發光。
國家高速網路與計算中心（國網中心）已經陸續打造多台運算功能強大的超級電腦，展區讓遊客化身為超級電腦工程師，運用電腦基礎的二進位知識，依照節奏按下代表0與1的按鈕，指揮超級電腦高效運算，解決大量的運算任務，展區還展示台灣杉二號超級電腦1/10的模型。
