國研院海洋中心今（15）日舉行記者會，介紹「深海高流量eDNA採樣模組」開發成果。
海洋中心助理研究員王豐寓表示，深海生態系脆弱，具有有高壓、低溫、生物密度低等特性，要了解深海生態，可透過底拖網、水下攝影機等方式進行，但分別有衝擊生態嚴重、觀察範圍太小等問題，而「環境去氧核醣核酸（eDNA）」技術，是透過收集環境中生物遺留的微量細胞、組織或排泄物，再利用分子生物學技術分析其中的遺傳物質，藉以推測環境中可能存在或活動的生物，不必直接捕捉或干擾生物本身，近年成為全球生物多樣性調查的重要工具。
王豐寓說，傳統eDNA技術主要以「採水過濾」方式進行，研究人員取得約1到2公升的水體並過濾後，透過聚合酶連鎖反應（PCR）放大特定基因訊號，再結合次世代基因定序技術（NGS），將定序完成的基因與資料庫比對，就能找出水中涵蓋的DNA碎片的物種名單，但此方式每次分析只能針對單一類群的生物，例如僅限魚類或僅限甲殼類，難以一窺整體生態的樣貌，且放大基因訊號的過程，也可能因不同物種基因片段的差異而產生結果偏差。
王豐寓指出，為解決此一困擾，海洋中心自主研發出全球首創「深海高流量eDNA採樣模組」，整合可耐受深海高壓環境的深海馬達、可精準定量且具低樣本污染風險的蠕動幫浦，以及可依研究需求更換孔徑的過濾模組，每小時過濾超過100公升深海海水，大幅提高深海eDNA採集效率，且後續分析方面也導入「第三代基因定序」技術，直接對足量的深海eDNA進行定序，減少傳統PCR放大可能造成的偏差，如此一來可以提升資料真實性，更可同步解析不同生物類群，突破過去只能針對單一物種類群分析的限制，更加真實反映深海的生物多樣性。
他也提到，研究團隊已於台灣西南海域進行實地測試，將採樣模組布放至深海海床，設備於海底自動過濾一小時，並於隔日順利回收，經後續基因定序分析，共獲得超過2200萬條環境DNA序列，經資料庫比對後，辨識出365種深海生物DNA，包括魚類、軟體動物、甲殼類、深海珊瑚，以及棘皮動物等。
至於使用eDNA調查深海生態的缺點，海洋中心主任廖德裕說，主要缺點是無法進行生物個體定量，不能知道個體數量，另外，有些相對冷門的生物，現有資料較少，可能無法透過DNA比對出來。
媒體詢及，透過eDNA技術，是否能了解海洋生態異常的警訊，王豐寓指出，此一用途會需要搭配長期觀測，就有機會得知海洋生態變化的徵兆。
