2026年度公費流感及新冠疫苗第一階段今天開打，對象包括11大類：
醫事及衛生防疫相關人員
65歲以上長者；55至64歲原住民
安養、長期照顧(服務)等機構之受照顧者及所屬工作人員
滿6個月以上至國小入學前幼兒(新冠疫苗僅包含未滿6歲且從未接種新冠疫苗者)
孕婦
具有潛在疾病者，包括高風險慢性病人、BMI≧30者、罕見疾病患者及重大傷病患者(新冠疫苗包含結核病、失能、精神疾病及失智症患者)
出生未滿6個月嬰兒之雙親或實際扶養者
幼兒園及托育機構工作人員、居家托育人員(保母)
國小至高中(職)／五專一至三年級學生（僅為公費流感疫苗對象）
禽畜相關及動物防疫相關人員（僅為公費流感疫苗對象）
第二階段則自11月2日起，2種疫苗均開放50至64歲無高風險慢性病成人接種。
打3種疫苗可拿1950健康幣
疾管署最新疫情監測資料顯示，國內流感疫情持平，後續幾周就診數皆呈現單周13萬例上下波動，是否如先前推估，單周達16萬高峰仍需觀察，預計10月中旬才會開始往下降；此外，國內COVID-19疫情疫情下降，不過仍處流行期。
疾管署發言人林明誠指出，今年10月1日起，年滿18歲民眾完成疫苗接種就可累積「健康幣」，接種新冠、流感及肺炎鏈球菌疫苗分別可獲得900、450、600健康幣，共計1950幣，呼籲民眾一起「顧健康」又「賺飽幣」，投資自己的健康，累積的健康幣可於12月1日起兌換健康商品。
公費流感與新世代新冠疫苗到位
疾管署說明，本年度流感疫苗接種計畫採購標準型流感疫苗約644.9萬劑與加強型流感疫苗約17萬劑，開打後可視實際需求再分別額外下訂20萬劑與3萬劑，其中加強型流感疫苗將優先提供安養、長照（服務）機構65歲以上受照顧者及機構所屬工作人員接種，以因應人口結構變遷及季節性疫情挑戰。
疾管署提醒，符合本年度公費流感疫苗接種資格的民眾，應踴躍接種，以於流感疫情高峰期來臨前獲得足夠保護力。新冠疫苗部分則已採購220萬劑Moderna新冠疫苗，包括190萬劑單劑型及30萬劑多劑型，其中190萬劑單劑型適用於12歲以上民眾接種，已全面升級為新世代疫苗，所含抗原劑量為前一代疫苗的1/5，實證資料顯示，接種後發生發燒及任何局部不良反應的比例約減少一半；且臨床研究顯示，其可誘發近2倍的抗體反應，較前一代疫苗可提供更佳的免疫保護力。
公費4000家合約院所可接種 自費7家打得到
疾管署表示，2026年度全台合計約有4000家流感/新冠疫苗接種合約院所。疫苗開打後，民眾可透過各地方政府衛生局網站、疾管署「流感新冠肺鏈疫苗及流感藥劑地圖」(VAX MAP)、疾管家或撥打1922防疫諮詢專線，查詢鄰近合約院所，再致電院所預約接種，以確保能順利接種疫苗並減少現場排隊等候時間。
疾管署提醒，前往接種時，請攜帶健保卡及相關證明文件，例如兒童健康手冊、孕婦健康手冊等；55至64歲原住民如欲於第一階段接種，除健保卡外，另應出具戶籍謄本、戶口名簿或其他原住民身分證明文件。另請接種合約院所配合妥善安排接種動線，讓已預約民眾優先接種，並視現場情形適時增加人力，協助疏導人流，以提升接種效率及服務品質；如果不屬於新冠疫苗公費接種對象但有自費接種需求，可至全國7家自費接種服務診所自費接種。
流感疫情持平仍在流行期
依據疾管署監測資料顯示，國內流感疫情持平仍處流行期，第38周（9/20-9/26）類流感門急診就診計138,654人次，較前一周略降3.2%，主要受連假門診休診影響。另上周（9/22-9/28）新增87例流感併發重症病例及30例死亡，預估流感疫情要到10月中旬才會開始往下。
疾管署疫情中心副主任李佳琳說，目前社區中流行的流感病毒以A型為主，其中以A型H1N1占87.7%為高。本流感季累計1673例重症病例及334例死亡，其中重症病例以65歲以上長者及具慢性病史者為多，67.7%未接種本季流感疫苗。
疫苗接種可累積健康幣
新冠疫情部分，李佳琳表示，國內新冠肺炎疫情下降，惟仍處流行期，第38周新冠門急診就診計1萬502人次，較前一周下降28.4%；上周新增33例本土重症病例及14例本土死亡病例。2025年10月起累計756例新冠併發重症本土病例，其中147例死亡，重症病例以65歲以上長者及具慢性病史者為多，83.6%未接種本季新冠疫苗；近4周本土病例變異株以PQ.16.1.1及NB.1.8.1為主。
