卓榮泰今早在行政院會臨時動議時表示，今天立法院是本會期的最後一天，許多重要法案在進行當中，「國防自主無人載具採購特別條例」是國防自主以及國家安全最重要的一項，透過採購特別條例編列特別預算，期待由國防部來主導此重要法案跟預算；如果要併同一般的商業發展來共同推動，行政院也表示歡迎，「但本末不能倒置」，由國防部的力量來主辦是政院要非常堅持的部分。
卓榮泰說，期待立法院不要以法律案夾帶預算的方式，有礙憲政體制的正常運作。行政院提出特別條例、特別預算，立法院無法在審查預算中增加預算，也不宜在法律案當中夾帶預算案。過去兩年這種狀況經常發生，讓兩院之間陷入對憲政認知上的分歧。
卓進一步說，從政策、預算、執行面來看，行政院跟立法院兩院分得很清楚。行政院負責制定政策、編訂預算，負責執行；立法院就行政院提出的政策，如果有需要制定法律案，可以就法律案來進行討論跟修正。行政院提出預算之後，立法院進行審議，這是憲法上所賦予的。而在執行方面，行政院當然負責執行，立法院無法負責執行，但是立法院如果要通過法律或是措施來改變執行過程，會造成執行上的困擾。
卓榮泰強調，行政歸行政、立法歸立法，該屬於行政院的權力，立法院不該侵犯；而該立法院的權力，行政院絕對會尊重。兩院關係才會和諧，憲政的體制才會正常運作。因此特別向立法院提出呼籲跟拜託，在最後關鍵時刻，要做出對憲政體制最好的決定。
