目前蛋中雞及蛋雞場面臨5大困境，1.蛋農年紀大，不想再花錢，轉型意願不高；2.禽舍老舊，生產效率差；3.禽流感疫情氣候變遷；4.環境髒亂生物安全不佳；5.雞糞清運及臭味。
畜試所副研究員蔡銘洋說明轉型措施，選擇良好蛋中雞，輔導出生到開始產蛋階段的防疫接種及光照管理、體重調節；導入智能化環控水簾雞舍；輔導雞糞處理，拖糞帶、雞糞發酵或乾燥處理，雞糞1年產值3億元，可增加雞農收入。
畜試所所長黃振芳說明何謂「蛋中雞」，就是產蛋雞在還沒產蛋前約120天內，重要之處在於，大眾都知孩子不能輸在起跑點，家長會把孩子送去補習班，蛋中雞也是一樣，體重和整齊度關乎蛋雞產蛋性能，未經輔導轉型前，蛋雞體重大約700公克，輔導後可達800公克。
措施可讓蛋中雞整齊度由78％提升至86%、產蛋率也由75.8％提高至89.4％，另外，飼養周期可由10個月增加至12個月；但改建設備後，成本計算1隻雞就要花費1000元，若飼養規模2萬隻，等於砸2000萬元，雖然農業部有補助一半，但需自行負擔1千萬，預估回本要花10年，雖然設備可使用30年，不過蛋農年老、後輩不見的願意承接，導致投入的農民不多，增設水簾等降溫設備僅20至30戶，佔比約10％，高達9成仍維持傳統飼養。
